Museon valokuvakokoelma sisältää kuvia lähinnä Aaltosen teolliseen toimintaan liittyen.
Kenkä- ja nahkateollisuuteen liittyvä valokuvakokoelma. Emil Aaltosella oli omistuksessaan useita tamperelaisia kenkätehtaita: Aaltosen Kenkätehdas, Attila ja Solena. Lisäksi Aaltonen omisti Viialan Nahkatehtaan ja Korkeakosken Kenkätehtaan. Kokoelmaan sisältyy sisä- ja ulkokuvia tehtaista sekä laajahko kokoelma valokuvia Aaltosen tehtaissa valmistetuista kengistä.
Lokomo-kokoelma. Museolla on hallussaan kattava kokoelma kuvia Lokomon, Rauma-Repolan ja Metson teolliseen toimintaan liittyen. Kokoelmaan kuuluu sisä- ja ulkokuvia tehtaista sekä kuvia tehtaiden valmistamista tuotteista. Erikseen voidaan mainita veturikokoelma, joka sisältää kattavan kokoelman valokuvia Lokomolla valmistetuista vetureista.
Sarvis-kokoelma. Emil Aaltonen oli mukana Sarviksen toiminnassa alusta lähtien ja suurin omistaja hänestä tuli vuonna 1926. Kokoelmaan sisältyy lähinnä sisä- ja ulkokuvia Sarviksen tehtaalta sekä kuvia Sarviksen valmistamista tuotteista.
Ylikartano-kokoelmaan sisältyy kuva-aineistoa Emil Aaltonen omistamalta Ylikartanolta.
Edellä mainittujen lisäksi museon kokoelmiin sisältyy Emil Aaltosen yksityiselämään liittyvää valokuva-aineistoa.